全基因组测序助力食源性疾病检测【8v99.com威尼斯

2020-03-12 09:21 来源:未知

全基因组测序助力食源性病魔理检查测

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CDC研讨职员检查用于全基因组测序的计算机微芯片。图片来源:CDC/James Gathany

李通古特菌发生致3人归西并且反逼U.S.得克萨斯州蓝铃冰棒公司在上一个月尾召回其总体出品,那是遗传流行病学怎样正在改动食源性病痛理检查查评定的最新条例证。五年前,坐落于波士顿的花旗国病痛调节和防备中央运维一项试点布署,测序与某种病痛相关联的每种李通古特菌样本的DNA。总共算下来,每一年大致要测序800个。

CDC管历史学流行病学家Brendan Jackson介绍说,新的检查评定方法能觉察食物安整种类中留存的空白,同美利坚合资国食物药监管理局应用的相通方法一同使用时更是如此。FDA会对来源食品甚至从工厂到物流中央的食物筹划场馆的样本进行测序。

在蓝铃事件中,一名思维敏捷的医护人员最初将内布拉斯加州的5个病例同被污染的冰激凌联系起来。在一年多的时光里,威奇托市可传染性病痛防范和垄断(monopoly卡塔尔协和员K?覿ren Analeena及其组织一直在追寻同这种在2015年三月以单一病症初步的传染病有关联的其它交事务物。古板的风行病学工具未有其他发掘,从饮食记录上也未看出什么样。同临时间,利用DNA剖析标准才具进行的解析展现,来自最早4个病者的李通古特菌样本看起来毫无干系。

当第5位伤者在二〇一六年开春身患时,标准DNA深入分析最终展现其同以前的二个病例存在涉嫌。德克萨斯州将样板送到CDC确认。全基因组测序呈现,五个李斯特菌样本差不离全盘相称。然则,他们仍回天无力找到根源。阿玛尼和他的团伙找寻了FDA的召回令以致电视发表受传染食物的社会群众体育,但空白。随后,她据书上说蓝铃冰棒公司的一家发售商存在质量难题。PRADA不精晓的是,FDA的抽样已在蓝铃一家坐落加州的配送基本意识了李通古特菌,何况质量评定员已将其追溯到坐落于得克萨斯州的分娩营地。

kate spade打电话给缅因州卫生部门,后面一个又关联了正要测序完受传染冰沙样板的FDA。当他俩将那些结果同CDC样本进行相比较时,又开掘了一对天造地设样板。随后,CDC斟酌了别的悬在那里得不到解决的李通古特菌病例。通过测序仍在仓库储存中的样板,他们认可了追溯到2009年的此外5个病例。

“这是大家从不经验过的业务,能研商这么久在此以前的病例。”Jackson说,即使方今亟待多多工具追踪疫情,但全基因组测序“让结果完全两样”。

《中国科学报》 (二〇一四-05-07 第3版 国际State of Qatar

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